胆汁反流性胃炎的治疗目前十分困难，无法完全治愈，药物停用后无法阻止胆汁反流的发生或胆汁对胃粘膜的损伤。武汉国医堂医院胃肠专家表示目前治疗药物有以下几个方面：
　　
　　（1）络合胆酸   有阴离子交换树脂，其代表药物有消胆胺和考来替泊。胆酸结合后经肠道粪便排出，阻断了胆酸的肠肝循环，影响脂肪、脂溶性维生素的吸收；铝碳酸镁（达喜），它在胃内有结合胆酸和溶血性卵磷脂的能力，在酸性环境下结合率达100%，可减少胆汁对胃的刺激。
　　
　　（2）促胃肠动力药  能增强食管、胃的蠕动，改善胃肠道排空和胃窦十二指肠协调收缩，减少胆汁在胃内停留时间如多潘立酮（吗丁啉）和莫沙必利。
　　
　　（3）胃粘膜保护剂   有铝碳酸镁、硫糖铝、枸橼酸铋钾等，可在胃内形成保护膜，防止胃酸及胃蛋白酶对胃粘膜损伤，抑制胃蛋白酶活性，增强前列腺素合成。
　　
　　（4）抑酸剂   有H2受体阻滞剂及质子泵抑制剂，如雷贝拉唑、雷尼替丁、奥美拉唑等，能有效的抑制胃酸分泌，减轻胆酸对胃粘膜的损伤。